Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP18Q9UMW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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USP18Q9UMW8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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