Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNIKQ9UKE5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms