Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPG2Q9UBF2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms