Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCMF1Q9P0J7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms