Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MIS18AQ9NYP9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms