Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms