Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBQLN4Q9NRR5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBQLN4Q9NRR5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms