Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms