Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms