Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA5Q9BWX5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms