Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR3CQ9BUI4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms