Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERPUD2Q9BSE4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms