Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NSMCE2Q96MF7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms