Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERAC1Q96JX3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms