Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms