Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms