Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJD3Q8N144 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms