Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGDCC3Q8IVU1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGDCC3Q8IVU1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms