Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUX4L9Q6RFH8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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