Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms