Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL35Q6PF15 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms