Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFCAB12Q6NXP0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms