Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms