Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL1Q5TGJ6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL1Q5TGJ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms