Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RTN1Q16799 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTN1Q16799 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
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