Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FXNQ16595 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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