Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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