Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NTRK3Q16288 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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NTRK3Q16288 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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NTRK3Q16288 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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NTRK3Q16288 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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NTRK3Q16288 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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