Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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