Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6HQ13956 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PDE6HQ13956 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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