Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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DDX39BQ13838 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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DDX39BQ13838 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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DDX39BQ13838 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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DDX39BQ13838 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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