Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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CDH18Q13634 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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CDH18Q13634 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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CDH18Q13634 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDH18Q13634 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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