Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC173Q0VFZ6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms