Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms