Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFFO1Q0D2I5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms