Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPB1Q06547 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms