Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE3AQ05086 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms