Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN17P56750 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms