Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA8P53708 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA8P53708 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms