Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MVDP53602 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MVDP53602 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MVDP53602 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MVDP53602 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MVDP53602 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MVDP53602 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MVDP53602 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms