Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM4P49221 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGM4P49221 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGM4P49221 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms