Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RANGAP1P46060 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms