Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms