Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5C1P36542 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5C1P36542 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms