Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NUP214P35658 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NUP214P35658 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NUP214P35658 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NUP214P35658 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms