Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THBS4P35443 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
THBS4P35443 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
THBS4P35443 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms