Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGB2P26583 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMGB2P26583 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms