Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1P23471 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms