Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RAB5AP20339 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB5AP20339 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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