Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms